Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms