Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Msl2Q69ZF8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Msl2Q69ZF8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Msl2Q69ZF8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Msl2Q69ZF8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms