Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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