Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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