Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kiaa1549Q68FD9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms