Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top2bQ64511 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms