Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Ccdc18Q640L5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Ccdc18Q640L5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Ccdc18Q640L5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Ccdc18Q640L5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
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