Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms