Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms