Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sycp1Q62209 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms