Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms