Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Grik1Q60934 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik1Q60934 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms