Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp3Q60770 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms