Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms