Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eme2Q56A04 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms