Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms