Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Carmil2Q3V3V9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms