Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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