Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms