Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn13Q3UW68 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms