Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D130052B06RikQ3UW13 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D130052B06RikQ3UW13 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms