Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cracr2aQ3UP38 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms