Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nlrc4Q3UP24 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nlrc4Q3UP24 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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