Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms