Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms