Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms