Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf224Q3UIW8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms