Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Parp8Q3UD82 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms