Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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