Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q3U595 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U595 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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