Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssbp4Q3U4B1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssbp4Q3U4B1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssbp4Q3U4B1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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