Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hvcn1Q3U2S8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hvcn1Q3U2S8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hvcn1Q3U2S8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hvcn1Q3U2S8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hvcn1Q3U2S8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hvcn1Q3U2S8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hvcn1Q3U2S8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Hvcn1Q3U2S8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hvcn1Q3U2S8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hvcn1Q3U2S8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hvcn1Q3U2S8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hvcn1Q3U2S8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hvcn1Q3U2S8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hvcn1Q3U2S8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms