Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms