Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf149Q3U2C5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnf149Q3U2C5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnf149Q3U2C5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnf149Q3U2C5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rnf149Q3U2C5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rnf149Q3U2C5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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