Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdnep1Q3TP92 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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