Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms