Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc10Q3TLI0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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