Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nlrx1Q3TL44 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nlrx1Q3TL44 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nlrx1Q3TL44 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nlrx1Q3TL44 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nlrx1Q3TL44 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nlrx1Q3TL44 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nlrx1Q3TL44 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nlrx1Q3TL44 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nlrx1Q3TL44 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms