Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim7Q3TJD7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms