Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp39Q3TIX9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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