Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RubcnlQ3TD16 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RubcnlQ3TD16 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms