Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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