Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col24a1Q30D77 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col24a1Q30D77 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col24a1Q30D77 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms