Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms