Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cpne7Q0VE82 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cpne7Q0VE82 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cpne7Q0VE82 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cpne7Q0VE82 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cpne7Q0VE82 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cpne7Q0VE82 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cpne7Q0VE82 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cpne7Q0VE82 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cpne7Q0VE82 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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