Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms