Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Zc3h18Q0P678 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms