Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
MestQ07646 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
MestQ07646 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
MestQ07646 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
MestQ07646 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MestQ07646 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms