Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms