Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms